中国科学院北京生命科学研究院研究员赵方庆团队将环形核糖核酸研究提升至单细胞水平,根据17万余个细胞的相关数据,科研人员“绘制”出单细胞环形核糖核酸综合表达图谱,并建立起单细胞环形核糖核酸数据分析和资源平台。近日,相关研究成果刊发于《自然—通讯》杂志。
环形核糖核酸在生物体发育过程中发挥着重要作用,但传统的转录组测序方法无法反映出单个细胞环形核糖核酸的表达谱系特征及差异。技术的发展让捕获测定单个细胞中的环形核糖核酸成为可能,赵方庆团队收集整理了171个已发表的单细胞全长转录组数据集,包含人和小鼠的58种组织和细胞类型、共计17万余个细胞,通过建立基于单细胞转录组数据的环形核糖核酸识别和整合分析方法,分别在人和小鼠中识别出4万余个、13万余个高度可靠的环形核糖核酸分子。
通过这些数据,科研人员“绘制”出了一份单细胞环形核糖核酸的综合表达图谱,为揭示其在不同细胞类型及发育阶段的动态变化提供了重要资源。研究发现,环形核糖核酸的表达模式在不同细胞类型上具有高度特异性,并展示出其作为细胞类型标志物的应用潜力。(刘苏雅)